慢性乙肝治疗的总体目标是：最大限度地长期抑制或消除乙肝病毒。然而，耐药却成为患者抗病毒治疗路上的绊脚石，专家指出，慢性乙肝需要长期治疗，抗病毒治疗至少需要2年的时间，甚至更长。因此控制耐药成为抗病毒治疗的关键所在。
耐药一旦发生，原本对病毒有效的药物就会失去疗效或使疗效大大降低，进而造成患者病毒反弹、疾病进展；同时，耐药发生后的换药或者加药治疗，会加大患者发生耐药的风险，限制后续治疗方案的选择，使患者背负沉重的心理负担和精神压力，还会导致治疗费用上升；反复耐药会使患者丧失对治疗的信心，情绪低落导致免疫功能下降，从而使治疗效果大打折扣。心理专家指出，超过60%以上的乙肝患者表示过对上述问题的担心。
针对病毒耐药变异预防，专家提出三大策略：
1、合理选择核苷(酸)类似物抗病毒治疗的适应症。
2、降低耐药风险：对有抗病毒治疗适应症的患者，尽量在初始治疗时选用抗病毒作用强、耐药变异发生率低的药物。临床显示，已经发生耐药的病人治疗相对比初治病人更难，现在有一种“续贯疗法”，就是吃了几个月以后再换另外一个药，这种做法利少弊多，最后很容易产生耐药。临床数据显示，核苷初治的慢性乙肝患者使用恩替卡韦五年，93%的患者病毒载量降到不可测水平，五年累计耐药发生率仅为1.2%。
3、提高患者依从性：耐药发生往往是由于不配合治疗，不定期检查。因此，患者在用核苷(酸)类似物进行治疗期间，要遵医嘱按时、足量服药，尽可能地将病毒抑制在最低水平。此外，治疗期间还应定期检测，每3个月检测一次HBVDNA水平。
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