溶脲脲原体、人型支原体、生殖器支原体是正常人群泌尿、生殖道常见的寄生菌，但可致病。这类支原体可引起泌尿、生殖道感染，如非淋菌性尿道炎，女性阴道炎、盆腔炎，男性前列腺炎等。这些支原体都对四环素类药物敏感。
非淋菌性尿道炎可给予四环素治疗，剂量为每次0.5克，每6小时1次；或多西环素100毫克，每12小时1次。疗程5～7天。多西环素具强效、速效、长效作用而代替四环素作为首选。红霉素对溶脲脲原体的疗效稍逊于四环素。红霉素治疗剂量为0.5克，每8小时1次，疗程5～7天。
因四环素影响骨、牙生长，牙齿发育期（胚胎期至8岁），故妊娠妇女、哺乳妇女和8岁以下儿童不可使用。红霉素适用于8岁以下儿童，每日30～50毫克/千克体重，分3次服。对支原体感染相关的盆腔炎、肾盂肾炎、尿路结石等也应用四环素类、红霉素类药物治疗。氟喹诺酮类也可选用。尿道支原体对现有抗菌药物的耐药性也值得重视。有报道认为，溶脲脲原体与人型支原体对红霉素的耐药率增加。
此外，如有其他细菌混合感染，如盆腔炎症大多有需氧菌和厌氧菌混合感染，应加用能覆盖常见需氧和厌氧病原菌的抗菌药物。病原检查获阳性结果后依据药敏试验结果调整用药。
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