复发性生殖器疱疹在原发后1-4个月内发生。第一次Ⅱ型疱疹病毒感染后一年内将近60%患者复发，第一年可复发4-6次。以后根据个人免疫力的高低决定复发次数的多少。有学者发现Ⅰ型疱疹病毒感染后只有14%复发，大大低于Ⅱ型疱疹病毒感染的复发率。复发一般都在原处，但水疱数目、持续时间和自觉症状各有不同。

　　复发性生殖器疱疹多发生在外阴、阴道、宫颈及龟头等部位，尿道发病较少见。由于复发性生殖器疱疹反复发作又难以控制，有时疼痛较严重等原因，造成病人思想负担过重，而出现心理障碍害怕致癌、害怕传染给性伴侣、回避与性伴侣的性生活、不愿与异性交往、导致性功能障碍，影响家庭和睦，甚至发生抑郁症。

　　生殖器疱疹病毒与生殖器恶性肿瘤关系密切。早在60年代就有人提出引起生殖器疱疹的Ⅱ型疱疹病毒可能是宫颈癌的潜在致癌因子。近十多年来，已发现宫颈癌和性活跃有关，而Ⅱ型疱疹病毒又是性活跃人群中常见的致病因子，宫颈又常是病毒的复制部位，并且发现生殖器疱疹常常与宫颈癌并发。患过生殖器疱疹的妇女比未患过者得宫颈癌的危险性大5-10倍。最近，在宫颈癌组织、剥脱细胞或癌前期细胞中发现了Ⅱ型疱疹病毒特异抗原。从而表明Ⅱ型疱疹病毒在宫颈癌的发生过程中起了重要作用。另外，从阴茎癌病人的活检材料中也观察到单纯疱疹病毒样颗粒。然而表明单纯疱疹病毒是生殖器恶性肿瘤致病因子的直接证据，尚有待于进一步证实。

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